สถานวิจัยสถาบัน จัดตั้งขึ้นตามนโยบายมหาวิทยาลัยในการปรับโครงสร้างองค์กร โครงสร้างการบริหารและการจัดตั้งหน่วยงานสังกัดสำนักงานอธิการบดีใหม่ จากชื่อเดิม งานวิจัยสถาบันและสารสนเทศ กองแผนงาน โดยผ่านความเห็นชอบจากมติสภามหาวิทยาลัยในการประชุมครั้งที่ 5/2563 เมื่อวันที่ 5 พฤษภาคม พ.ศ.2563 มหาวิทยาลัยได้มีประกาศจัดตั้งสถานวิจัยสถาบัน ลงวันที่ 28 สิงหาคม 2563 ให้สถานวิจัยสถาบันเป็นหน่วยงานภายในสถานะเทียบเท่ากอง สังกัดสำนักงานอธิการบดี มีหน้าที่รับผิดชอบเกี่ยวกับงานด้านวิจัยสถาบัน การพัฒนาและสนับสนุนการวิจัยสถาบันเพื่อกำหนดนโยบายในการพัฒนาองค์กร และงานด้านอื่นๆ ที่เกี่ยวข้องกับการวิจัยสถาบันตามที่ได้รับมอบหมายให้ปฏิบัติ ในการดำเนินงานช่วงแรกสถานวิจัยสถาบันใช้ทรัพยากรทั้งหมดร่วมกับกองแผนงานเป็นหลัก ต่อมาเมื่อวันที่ 16 ตุลาคม 2563 สถานวิจัยสถาบันจึงได้ย้ายขึ้นมายังสำนักงานที่จัดสรร คือ ห้อง 2614 อาคารวิชาการ 2 ชั้น 2 และได้ดำเนินการบริหารจัดการตามพันธกิจภายใต้งบประมาณที่ได้รับจัดสรรของหน่วยงานในปีงบประมาณ พ.ศ. 2564